Ich denke, ich hätte das Problem vielleicht gelöst. Anstatt die Registrierungsschlüssel zu löschen, habe ich sie wieder hinzugefügt und alle auf "0" gesetzt, wodurch diese Funktion weitgehend deaktiviert wird. Es ist mehr als 5 Minuten her, seit sich mein Computer nach einem Wol-Event eingeschaltet hat.
Update: Nach einigen Tagen mit den neuen Einstellungen ist das Problem nie wieder aufgetreten!