Die Reihenfolge der Startgeräte befindet sich im System-BIOS. Sie sollten zuerst prüfen, ob die richtige Festplatte als erstes Startgerät aufgeführt ist. Es sollte jedoch versuchen, von anderen Festplatten als USB zu booten, sofern dies konfiguriert ist. Auf diese Weise können Sie den USB bei Bedarf als "überschreibende" Bootdiskette belassen - und ein bootfähiges USB-Medium haben.
Der andere Ort, an dem diese Abhängigkeit sein kann, ist der Bootloader (z. B. GRUB oder Lilo). Stellen Sie daher sicher, dass der Bootloader auch auf die richtige Festplatte zugreift. Bei einer typischen Installation sollte das System von der ersten Festplatte (hd (0, 0) in GRUB) starten.