Ich habe genau das gleiche Problem mit nur einer Datei! Mein Problem war, dass diese bestimmte Datei sowohl in Kleinbuchstaben als auch in Großbuchstaben vorhanden war. Ich habe mein Problem gelöst, indem ich die gleichnamige Großbuchstabe kopiert habe, indem ich dem Dateinamen 2 hinzufügte:
xt_CONNMARK.ko (zweimal mit demselben Inode aufgeführt) in xt_CONNMARK2.ko kopiert
Jetzt wird xt_CONNMARK.ko einmal mit der neu kopierten Datei aufgelistet, xt_CONNMARK2.ko auch einmal!
Sehr sehr seltsames Verhalten aber gelöst?