Ich denke, Sie könnten eine Gentoo-Partition erstellen, sie irgendwo im Dateisystem mounten, sodass Sie während der Ausführung von Ubuntu darauf zugreifen können, dann chroot
darauf und die Kompilierung in der chrootierten Umgebung. Das ist im Grunde sowas, was Sie als Teil der Gentoo-Installation tun. (Die Installations-CD ist nichts weiter als eine minimale Gentoo LiveCD, die Sie zum Einrichten einer Arbeitsumgebung zum Herunterladen von Dingen verwenden.)
Tatsächlich benötigen Sie nicht einmal die Gentoo-Installations-CD, da Sie bereits über eine Linux-Umgebung verfügen. Schauen Sie sich die alternativen Installationsanweisungen an und blättern Sie zu Abschnitt 5, "Gentoo von einer vorhandenen Linux-Distribution installieren ".