Ich würde empfehlen, ProcMon zu verwenden - dies zeigt Ihnen, welche Prozesse Dateien, Ordner und Registrierungseinträge erstellen, lesen und ändern . Sie können nach Registrierungseinträgen filtern, die mit einer bestimmten Maske übereinstimmen (Sie müssen dies tun, da es sehr schnell mit allen auf Ihrem Computer vorkommenden Dingen spammt).
Hoffentlich hilft Ihnen das dabei, herauszufinden, wo Ihr Problem liegt.