Das erste, was ich in Windows mache, ist die Adobe Reader Firefox-Erweiterung zu deaktivieren. Die neueste Version ist wirklich scheiße.
Dann sollten Sie die PDFs erneut herunterladen. Möglicherweise möchten Sie sie noch in Adobe Reader öffnen, aber das Ändern der Standardanwendung für PDFs in Ubuntu sollte dies verhindern.
Klicken Sie mit der rechten Maustaste auf eine PDF-Datei und wählen Sie "Mit anderer Anwendung öffnen". Wählen Sie Ihre bevorzugte Anwendung aus und aktivieren Sie die Einstellung "Diese Anwendung für PDF-Dokumentdateien speichern".