Das Problem liegt weder bei RDESKTOP noch bei Windows. Es ist von der Art, wie Linux (und andere Betriebssysteme) mit Wechselmedien arbeiten. Sie sollten sicher entfernt und anschließend entfernt werden, um sicherzustellen, dass frisch geschriebene Daten synchronisiert wurden.
Sie können Ihr System informieren, damit diese "Synchronisierungen" häufiger vorgenommen werden.
Sie können einen C-Daemon schreiben, der dies für Sie tun würde. Oder Sie können in die Kernel-Moduleinstellungen einsteigen und angeben, dass der Schreibcache nicht verwendet werden soll.