Mit FAT32 können Sie fast überall arbeiten.
Ich habe Probleme mit der Dateigrößenbegrenzung, die nach heutigen Maßstäben nicht mehr so groß ist. Da exFAT noch nicht unter Linux verfügbar ist, habe ich nach Alternativen gesucht und es ist wirklich schwierig, etwas Passendes zu finden.
UDF war einst als plattformübergreifendes und medienübergreifendes Dateisystem gedacht, wurde aber irgendwie vergessen. Es gibt eine Option zum Formatieren von UDF für Festplatten, die sich durchaus für Wechseldatenträger eignet, aber meiner Erfahrung nach ist die Unterstützung unter Windows, wenn überhaupt, minimal. Ich weiß nicht, ob Windows 7 andere UDF-Laufwerke als BluRay-Discs unterstützt.
Ich entschied mich für die Verwendung von NTFS für meine externen Laufwerke, die an Windows-Computer sowie an Linux-Computer angeschlossen werden müssen. Bei meinen Wechseldatenträgern, die hauptsächlich auf Linux-Computern verwendet werden, verwende ich XFS.
Dasselbe Problem gilt auch für die Verschlüsselung: Ich verwende LUKS unter Linux, das unter Windows etwas unterstützt wird. TrueCrypt kann im Vergleich zu LUKS nicht zu gut in Linux-Systeme integriert werden, daher habe ich mich dazu entschieden.