Tut mir leid, wenn sich das flippig anhört, aber Sie könnten zu einem anderen Terminal wechseln (zum Beispiel dem mit XFCE mitgelieferten). Ich schlage vor, dies ist, weil AFAIK, gnome-terminal nur seine Einstellungen von gnome-settings-daemon bezieht.
Eine andere Möglichkeit, das Problem zu beheben, könnte xsettingsd sein: https://code.google.com/p/xsettingsd/
Es soll ein Ersatz für gnome-settings-daemon sein. Ich führe es aus, aber da ich nicht viele GNOME-Apps betreibe, kann ich nicht mit Sicherheit sagen, dass es tatsächlich funktioniert (meistens habe ich es vor langer Zeit einmal eingerichtet, und da es nicht wirklich funktioniert) Verwenden Sie so viele Ressourcen, ich lasse es einfach in Ruhe).