Mit Virtualbox (oder VMware sollte es ähnlich sein), sollten Sie in der Lage sein, "Snapshots" zu verwenden, um ein Rollback auf einen früheren Status durchzuführen.
Die VM muss ausgeschaltet sein, damit der VM-Status "Snapshot" werden kann. Sie können mehrere Momentaufnahmen erstellen.
Ich habe empfohlen, die Netzwerkkarte in Vbox / VMware auszuschalten, bevor Sie mit der Malware fummeln.
Was "wie" die Änderungen der Malware als erledigt ausfindig macht, ich kenne diesen Teil nicht.