Haben Sie JavaScript aktiviert? Wenn Sie versuchen, die Seite zu aktualisieren, sollte eine Alertbox angezeigt werden. Das wird für Kommentare jedoch nicht passieren.
Möglicherweise kann durch die Verwendung eines anderen Add-Ons neben AutoRefresh das Problem gelöst werden. Ich weiß, dass Tab Mix Plus und ReloadEvery keine domänenweite automatische Seitenaktualisierung durchführen können. Sie können sie jedoch für einzelne Registerkarten aktivieren. Durch das Deaktivieren der Aktualisierung für eine Registerkarte beim Schreiben einer Antwort kann die andere Erweiterung außer Kraft gesetzt werden.
Edit: Ich kann keine Spur eines AutoRefresh-Plugins finden. Verwenden Sie dieses für die Domäne aktivierte Greasemonkey-Skript?