Wenn Sie Windows von einem FAT32-Dateisystem ausführen, gibt es keine auf Dateisystemen basierende Sicherheit (dazu benötigen Sie NTFS).
Als Folge davon wäre eine solche Windows-Installation eine offene Einladung zu Viren / Malware auf der ganzen Welt.
Das Ausführen von Windows unter Fat32 ist daher nur für Installationsmedien nützlich. Microsoft hat sich nie die Mühe gemacht, den Standard-Windows-Dienstprogrammen eine Option zu geben, um einen MBR auf FAT32-Wechselmedien zu schreiben.
Mit USB-Stick-Format-Dienstprogrammen von Drittanbietern ist dies jedoch ganz einfach.