Das Verschlüsseln des Laufwerks selbst wäre wahrscheinlich in Ordnung - Sie müssen lediglich das Laufwerk / die Partition entsperren, bevor Time Machine darauf zugreifen kann.
Aber ehrlich gesagt, Sie haben Mac OS gebeten, ein verschlüsseltes Backup zu verwenden, und die Verschlüsselung kostet mehr Zeit ... also lassen Sie es einfach sein und lassen Sie Ihre Daten sicher aufbewahren. Wenn Sie Dateien haben, die zu groß sind und zu oft geändert wurden, um mit Time Machine effizient auf der verschlüsselten Festplatte gesichert zu werden, sollten Sie besondere Vorkehrungen für diese Dateien treffen (und sie von TM ausschließen), damit sie Ihre TM nicht blockieren Sicherungsprozess.