Haben Sie über die Verwendung der JSON-Exportfunktion von RRDTool nachgedacht?
Sie können den Inhalt der RRD-Datei zunächst nach JSON exportieren, das erheblich leichter als XML ist, und dann analysieren und nach Ihren Wünschen bearbeiten.
http://oss.oetiker.ch/rrdtool/doc/rrdxport.de.html
Erwähnenswert sind auch einige PERL- und R-Pakete, die Ihnen dabei helfen können, Ihr Ziel zu erreichen.
RRD-Editor für PERL: http://search.cpan.org/~dougleith/RRD-Editor/lib/RRD/Editor.pm
Für R: https://github.com/pldimitrov/Rrd