Ich konnte dieses Verhalten duplizieren, indem Sie auf Einstellungen -> Kacheln gehen und im Startbildschirm auf Persönliche Informationen aus Kacheln löschen klicken. Danach wird die Anzahl der Updates nicht auf dem Startbildschirm angezeigt.
Um dies umzukehren, gehen Sie in der Store-App zu Berechtigungen und schalten Sie Benachrichtigungen aus und wieder ein. Auf meinem 8.1-Computer wurde die auf dem Startbildschirm angezeigte Aktualisierungsnummer erneut aktiviert.