Ich kenne kein Werkzeug, das Wiederherstellungspunkte vergleichen kann.
Wie in Dump Registry auf Textdateien zur Nachverfolgung ausführlicher erklärt, können Sie die beiden Dateien jedoch ganz einfach wiederherstellen und dann die gesamte Registry als zwei (riesige) Textdateien exportieren. Sie können dann ein Textvergleichsprogramm verwenden, um die Unterschiede herauszufinden.
Wenn Sie sich für diese Lösung entscheiden, vergessen Sie nicht, einen aktuellen Systemwiederherstellungspunkt zu erstellen, zu dem Sie zurückkehren können.