Nach meiner Erfahrung auf normalen Unix-Systemen muss Ihre authorized_keys-Datei über oktale Berechtigungen 600 verfügen, damit nur der Benutzer, der sie erstellt hat (und root), sie lesen kann, um zu verhindern, dass andere Benutzer die Datei sehen. Ich gehe davon aus, dass es in Cygwin genauso ist. Im strengen Modus werden Sie lediglich aufgefordert, die Berechtigungen zu ändern, wie Sie es herausgefunden haben.
Aus früheren Erfahrungen würde ich sagen, dass Sie richtig waren. Als Besitzer sollte es die Person sein, die die Dateien besitzt, und bedeutet wahrscheinlich "dieser Benutzer" in Ihrem Kontext.