Ihr Projekt wird nur in VS2012 "geändert", wenn Sie es zum ersten Mal in VS2012 öffnen (und Sie werden vor dem Ausführen der Konvertierung dazu aufgefordert). Wenn Sie das alte Projekt in VS2008 öffnen, funktioniert es einwandfrei.
Möglicherweise sehen Sie, dass die Dateizuordnung für Ihre Lösungsdateien geändert wird, sodass sie standardmäßig in VS2012 geöffnet wird. Um dies zu erreichen, müssen Sie VS2008 manuell öffnen und "altes Projekt" mit "Open Solution" laden, anstatt das Projekt über eine direkte Verknüpfung zu öffnen.