Dies ist ein seit langem bestehender Fehler im Gnome Virtual Filesystem Daemon (gvfsd), siehe hier: https://bugs.launchpad.net/ubuntu/+source/libsoup/+bug/760344 Grundsätzlich bereinigt gvfsd die Verbindungen nicht ordnungsgemäß CLOSE_WAIT-Status. Eine Verbindung im Zustand CLOSE_WAIT ist eine Verbindung, die von beiden Peers geschlossen wurde und das lokale System wartet, bis der lokale Client den Socket freigibt. gvfsd macht das nicht, daher sehen Sie alte geschlossene Verbindungen im Zustand CLOSED_WAIT.
Warum diese Verbindungen überhaupt erst eröffnet wurden, ist eine andere Frage. Übliche lokale Anwendungen, die Verbindungen über gvfsd öffnen, sind Zeitgeist, Softwarecenter und Rhythmbox. Sie können aber auch gvfsd-http-Verbindungen herstellen, indem Sie Objekte aus einem Webbrowser in Ihr lokales Dateisystem ziehen. Die etwas fleckige Dokumentation https://wiki.gnome.org/Projects/gvfs/doc gibt leider nur Hinweise darauf, was hier passiert.
Wenn Sie wissen möchten, welche Pakete von gvfsd abhängen, müssen Sie diese ausführen
apt-cache --installed rdepends libsoup
Von dort aus können Sie entscheiden, welche davon Sie wirklich behalten möchten.