Wenn sich die Torrents im Zielordner des Torrents befinden (siehe Bearbeiten -> Voreinstellungen, dann auf der Registerkarte Torrents), wird Transmission dies einfach feststellen und Sie müssen nichts tun.
Wenn die Torrent-Dateien an einem anderen Ort leben, erstellen Sie einfach einen symbolischen Link vom Torrents-Downloadverzeichnis zu ihrem aktuellen Speicherort.