start
hat eine seltsame Syntax, bei der die erste Zeichenfolge in Anführungszeichen der neue (Konsolen-) Fenstertitel ist. Ihr Befehl wird in Anführungszeichen gesetzt, start
interpretiert ihn also als Titel und weiß nicht, was /s
ist.
Fügen Sie also einen Dummy-Titel hinzu:
START /WAIT "" "%userprofile%\desktop\jre-8u25-windows-i586.exe" /s