Es scheint ein bekanntes Problem zu sein, es gibt eine laufende Debatte über diesen Upstream: https://code.google.com/p/android/issues/detail?id=66696
Sie sagen, der Build sollte einen gemeinsam genutzten Thread-Pool verwenden, der Parameter zum Einstellen der Größe ist -Pandroid.threadPoolSize=<count>
und sollte in Android Studio 2.3 Beta 3 verfügbar sein.