Anstatt die Direktive im Standardblock zu ändern, sollten Sie einen separaten Block speziell für Ihr Projektverzeichnis verwenden:
<Directory /var/www/html/project1> Options Indexes FollowSymLinks AllowOverride All Order allow,deny allow from all Require all granted </Directory>
Dies ermöglicht nur die Verwendung von .htaccess-Dateien in diesem bestimmten Verzeichnis.
Der 500-Fehler, den Sie erhalten, ist möglicherweise auf eine fehlerhafte Syntax in einer .htaccess-Datei zurückzuführen. Es wäre hilfreich, wenn Sie uns zeigen würden, was Sie in allen .htaccess-Dateien haben.
Alternativ können Sie in den Apache-Fehlerprotokollen unter /var/log/apache2/error.log nach genaueren Informationen zum Fehler suchen.