Fehler beim Installieren von Pysam in Cygwin

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Kristen

Ich bin neu bei Cygwin und Python. Ich versuche Pysam zu installieren, bekomme aber am Ende folgende Fehler:

Traceback (letzter Aufruf zuletzt): Datei "", Zeile 1, in Datei "/tmp/pip-install-imo2XD/pysam/setup.py", Zeile 223, in htslib_make_options = run_make_print_config () Datei "/ tmp / pip- install-imo2XD / pysam / setup.py ", Zeile 69, in run_make_print_config stdout = subprozess.check_output ([" make "," -s "," print-config "]) Datei" /usr/lib/python2.7/ subprocess.py ", Zeile 212, in check_output process = Popen (stdout = PIPE, * popenargs, ** kwargs) Datei" /usr/lib/python2.7/subprocess.py ", Zeile 390, in init errread, errwrite) Datei "/usr/lib/python2.7/subprocess.py", Zeile 1025, in _execute_child raise child_exception OSError: [Errno 2] Keine solche Datei oder Verzeichnis

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Befehl "python setup.py egg_info" schlug mit Fehlercode 1 in / tmp / pip-install-imo2XD / pysam / fehl.

Wenn ich versuche, nur $ python setup.py egg_info

python: Datei 'setup.py' kann nicht geöffnet werden: [Errno 2] Keine solche Datei oder Verzeichnis

Was / Wie installiere ich?

Jede Hilfe wird geschätzt!

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pysam erfordert wahrscheinlich die samtools http://samtools.sourceforge.net/ als Schnittstelle, die auf cygwin nicht verfügbar ist matzeri vor 5 Jahren 0

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