Microsoft hat erst vor kurzem mit der Erweiterung der Skype for Business-API begonnen (die meisten davon werden noch als Beta bezeichnet). Wenn Instabird keine dieser Schnittstellen implementiert, kann Skype for Business nicht als Server verwendet werden. Derzeit sind die einzigen Beispiele, die ich mit der API gesehen habe, webbasierte Chat-Clients, von denen ich keines in der Produktion gesehen habe.
Soweit mir bekannt ist, gibt es keine IM-Kunden von Drittanbietern auf dem Markt, die mit SFB zusammenarbeiten. Das Skype-Protokoll ist ebenfalls proprietär. Dies ist wahrscheinlich der Grund, warum es keine Clients gibt.