Es stellt sich heraus, dass Sie dazu nur eine Änderung vornehmen müssen. Wechseln Sie im Azure-Portal zu Azure AD und suchen Sie nach der Registrierung der Jira SAML SSO-App (das gleiche würde wahrscheinlich auch für andere SAML / SSO-Apps funktionieren, die die gleiche Anforderung haben).
Klicken Sie in dieser App auf den Link unter "Verwaltete Anwendung im lokalen Verzeichnis" und anschließend auf "Single Sign-On", um die SAML-Eigenschaften zu konfigurieren, die zurückgeschickt werden. Ändern Sie für die Benutzerkennung den Standardnamen name.userprincipalname in den passend benannten und geeigneten Namen "name.onpremisessamaccountname" und speichern Sie die Änderungen.