Bearbeiten >> Suchen >> In Pfad suchen (Dadurch wird das gesamte Projekt durchsucht.)
Durch Hervorheben eines Ausdrucks und Drücken von Strg-Alt-F7 wird auch die gesamte Verwendung gefunden.
Update: In der gerade verwendeten Version PyCharm Community Edition 2016.2.3 wird der Ausdruck hervorgehoben und die Tastenkombination Strg-Umschalt-F gedrückt.