Legen Sie das Home-Verzeichnis des Benutzers auf fest /var/www/site.com/public/files
und alles sollte in Ordnung sein. Natürlich müssen Sie den Inhalt seines aktuellen Home-Verzeichnisses verschieben. Der Befehl dafür lautet:
usermod -d /path/to/new/homedir/ username
Wo username
ist der Name des Benutzers, von dem Sie das Basisverzeichnis verschieben.